Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNDC3BQ96NL0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNDC3BQ96NL0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNDC3BQ96NL0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms