Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms