Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JSRP1Q96MG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms