Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE2Q96MF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE2Q96MF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms