Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
STAC3Q96MF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
STAC3Q96MF2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STAC3Q96MF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms