Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT6

C1orf74, UPF0739 protein C1orf74, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf74Q96LT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf74Q96LT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf74Q96LT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf74Q96LT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf74Q96LT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf74Q96LT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms