Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX27Q96L92 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX27Q96L92 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX27Q96L92 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms