Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALR3Q96L12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALR3Q96L12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms