Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms