Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
LRRIQ1Q96JM4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRIQ1Q96JM4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
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