Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARF2Q96GP6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARF2Q96GP6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms