Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP36Q96G28 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP36Q96G28 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP36Q96G28 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms