Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP6Q96FZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP6Q96FZ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP6Q96FZ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms