Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC97Q96F63 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC97Q96F63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms