Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SGTBQ96EQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms