Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHFRQ96EP1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHFRQ96EP1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms