Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPDL1Q96EA4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDL1Q96EA4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms