Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRRFQ96E11 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms