Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDF1Q96CC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms