Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ULK4Q96C45 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK4Q96C45 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms