Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMIGD2Q96BF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMIGD2Q96BF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms