Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC8Q96B26 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms