Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EME1Q96AY2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms