Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB7BQ96AH8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB7BQ96AH8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB7BQ96AH8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms