Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FUBP1Q96AE4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FUBP1Q96AE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms