Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35C1Q96A29 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC35C1Q96A29 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35C1Q96A29 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms