Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1E2Q96A05 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP6V1E2Q96A05 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms