Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UTP4Q969X6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UTP4Q969X6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms