Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C6Q969F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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GTF3C6Q969F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
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GTF3C6Q969F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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GTF3C6Q969F1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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GTF3C6Q969F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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GTF3C6Q969F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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GTF3C6Q969F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C6Q969F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C6Q969F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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