Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHMTQ93088 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHMTQ93088 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms