Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2A3Q93084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2A3Q93084 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2A3Q93084 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms