Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
USP9XQ93008 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP9XQ93008 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms