Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAD50Q92878 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAD50Q92878 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms