Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4DQ92854 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4DQ92854 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms