Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROX1Q92786 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PROX1Q92786 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PROX1Q92786 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms