Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4AQ8WYN0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms