Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR60Q8WVS4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR60Q8WVS4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
WDR60Q8WVS4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR60Q8WVS4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR60Q8WVS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR60Q8WVS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR60Q8WVS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR60Q8WVS4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms