Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCFD1Q8WVM8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms