Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST2Q8WVJ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms