Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRUNE2Q8WUY3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRUNE2Q8WUY3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRUNE2Q8WUY3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms