Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRN4Q8WUT4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN4Q8WUT4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms