Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH3Q8TE77 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSH3Q8TE77 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSH3Q8TE77 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms