Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP1Q8TDR0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms