Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC110Q8TBZ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC110Q8TBZ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC110Q8TBZ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms