Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATJQ8NI35 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PATJQ8NI35 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms