Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP35Q8NFH5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP35Q8NFH5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP35Q8NFH5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms