Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP43Q8NFH3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms