Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID1BQ8NFD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARID1BQ8NFD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms