Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSNK2A3Q8NEV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSNK2A3Q8NEV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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