Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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